Со временем стала расти SQL база DotNetNuke. Размер увеличился в несколько раз. Изучив таблицы наткнулся на таблицу SiteLog которая занимала 1,5 Гб на диске. 

Почистить ее можно зайдя под учеткой Host и выполнить в SQL следующую команду.

TRUNCATE TABLE {databaseOwner}{objectQualifier}SiteLog

Ну и после Shrink базы или BackUp в SQL Manager. База стала занимать 400 Мб вместо 2 Гб.